Nhuộm Moeller là một phương pháp nhuộm vi khuẩn sử dụng thuốc thử nhuộm hấp để nhận dạng nội bào tử[1] do Moeller đề xuất năm 1891.[2] Carbol fuchsin là thuốc nhuộm chính để nhuộm nội bào tử thành màu đỏ, xanh methylene là thuốc nhuộm bổ sung nhuộm tế bào dinh dưỡng (vegetative bacteria) của vi khuẩn.